โรคเรื้อรังหรือโรคประจำตัวบางชนิด ทำให้กระดูกบางลงกว่าปกติ จนเกิดเป็นภาวะกระดูกพรุนได้ หรือการรักษาบางอย่างก็สามารถทำให้เกิดกระดูกพรุนได้ซึ่ง เรียกว่า กระดูกพรุนชนิดทุติยภูมิ (secondary osteoporosis) ได้แก่
โรคต่อมไร้ท่อ ดังต่อไปนี้
- ภาวะต่อมไทรอยด์เป็นพิษ (Hyperthyroidism)
- ภาวะต่อมหมวกไตทำงานมากเกิน (Cushing’s syndrome)
- ต่อมพาราไทรอยด์ทำงานมากเกิน (Hyperparathyroidism)
- ภาวะขาดฮอร์โมนเพศ
- ภาวะขาดวิตามินดี Rickets หรือโรคกระดูกอ่อน ซึ่งพบบ่อยในเด็ก, ภาวะขาดแคลเซียม
- โรคเบาหวาน
มะเร็ง (เต้านม เม็ดเลือดขาว ต่อมน้ำเหลือง)
- การใช้ยาสเตอรอยด์ ต่อเนื่องเป็นเวลานาน
- โรคปวดข้อรูมาตอยด์
- โรคตับเรื้อรัง,การเสพติดแอลกอฮอล์, การสูบบุหรี่ (ทำให้เอสโทรเจนในเลือดลดลง) เป็นต้น